Correçao de template - Back End (Mvc, php, Sql.

Olá tenho um projeto iniciado, uma loja virtual. Estou hospedando na Hostgator, e o template do site eu comprei separado.
O template faz tudo que eu preciso, porem precisa de alguns ajustes e correções.


Atualmente estou com um impasse no sistema do template pra ser corrigido.
Quando um boleto e gerado, o template está interpretando como “pago”.
(Causando um problema de comunicação..
. Os vendedores serão informados como pago, produtos digitais liberam o botão de download na mesma hora... e por ai vai)

Creio que o conhecimento recomendável para esse caso em especifico seja conhecimento em php, sql, mvc e talvez codeigniter