Configurar servidor amazon Ec2 linux

Tenho um servidor na amazon com linux ubuntu
tenho ftp configurado
apache e tom cat instalado

mais estou com probelmas de acessos a pastas,
tento colocar um arquivo war na pasta do tom cat e da acesso negado,,, mesma coisa qdo tento deletar. (Via file zila)

por linha de comando usando linux não consigo enviar o arquivo.
Não sei se estou fazendo os comandos corretos ou á algum problema na configuração. Sempre fala que o arquivo a ser enviado não existe e dps pemissão de pasta.

1- configurar permissão de pastas e enviar este arquivo war para servidor (me ensinar fazer tb)
2 - configurar o ftp para poder enviar o arquivo via ftp (se possivel)
3 - instalar alguma interface grafica para o deploy dos arquivos, start e stop do tomcat (se possivel)


o prossional jah deve ter experiencia em comando linux e aws
ter paciencia para ensinar esse comandos do linux
ter disponibilade para hangout ou skype
acredito que não deve demorar mais de 3 horas de trabalho.