Aplicação de algoritmos/métodos estatísticos em software livre - python ou R

Preciso aplicar em uma base de dados, que pode ser escolhida pelo profissional, ou de preferência um banco de dados disponível e facilmente acessível na internet. Exemplos  https://archive.ics.uci.edu/ml/index.php

https://www.kaggle.com/datasets

Aplicar os seguintes métodos:
1)Clustering
- k-means
- PAM
- Clara
- Algoritmo Clustering Hierarquico Aglomerativo
- Algoritmo DBSCAN
- Complete-linkage clustering.
- Método Ward

Métricas de Avaliação

- Métricas Internas
    - Conectividade
    - Largura de Silhueta
    - Índice de Dunn

- Métricas de Estabilidade

    - métrica APN (Average Proportion of Non-overlap)
    - A métrica AD (Average Distance)
    - A métrica ADM (Average Distance between Means)
    - A métrica FOM (Figure of Merit)
    -

- Métricas Biológicas

    - BHI (Biological Homogeneity Index)
    - BSI: Biological Stability Index


2) Regressão Logística
- Chances (odds) e Raz ̃ao de Chances (Odds ratio)

3) K-Fold Cross-Validation
- M ́etodo leave-one-out

4)Lasso Regression

5)Ridge Regression

6)Elastic net

7) Redução de Dimensionalidade

- Mapeamento de Sammon
- Local MDS
- Metodo Supervised mds
- t-distributed stochastic neighbor embedding (t-sne)

preciso de 2 arquivos, um somente com os códigos e que seja replicável e outro com os resultados e uma análise bem sucinta.

Caso exista algum método que não consiga realizar, favor destacar qual seria.
Também possuo arquivos complementares que podem ajudar no trabalho.