Distribución de archivos a muchas computadoras

Mi petición es el desarrollo de dos aplicaciones java 1.8 de escritorio (javafx o swing).
En la primer aplicación el usuario deberá indicar el sistema destino de los archivos que se enviarán (sima, central, auto ó backend), seleccionará los archivos que desea distribuir y especificará la ruta de destino en que deberán ser copiados los archivos en las máquinas remotas (no todos los archivos irán a la misma ruta, se debe indicar individualmente, con la posibilidad de asignar la misma para todos). Al confirmar los archivos que desea distribuir la aplicación debe generar un zip con los archivos seleccionados, generar un archivo md5 de cada archivo y un archivo instalador ya sea XML o json que contenga la información de la ruta donde será copiado cada archivo.
La segunda aplicación correrá en cada una de las computadoras (aplicación System.tray) donde se distribuirán los archivos, consultará en una ruta local si tiene archivos que copiar validando si existe el archivo instalador (generado en la aplicación anterior), al encontrar el archivo la aplicación descompactará el archivo, y validara los archivos md5 para garantizar que la transmisión fue exitosa, y procederá a copiar cada archivo a la ruta de destino correspondiente de cada archivo.
Nota.- Ya se cuenta con el desarrollo que envía los archivos a las computadoras destino, este punto no es requerido que se cotice